Mohl bys použít
liveCD s Linuxem a v něm konzolový program
dd, který vytvoří soubor s bitovou kopií libovolného oddílu nebo oblasti disku. Tímtéž programem potom můžeš ten soubor zapsat na disk, stejný nebo úplně jiný.
Doporučuji zazálohovat všechny podivné oddíly které se na tom disku nacházejí a také zaváděcí sektor s tabulkou rozložení oddílů. Z toho se později dá zrekonstruovat celý disk do původního stavu i v případě jeho zničení a nahrazení jiným. Data musíš mít samozřejmě zálohovaná extra a radši několikrát!